纯净水设备能否长久正常运行重要的是维护，设备维护的细心，设备就得心应手。所以，在纯净水设备的运行时应该注意不要损坏机器。在纯净水设备的操作中应该注意：
1.防止滤料进入反渗透装置：选择合适的过滤器出水装置，防止过滤器漏砂漏活性炭。选择合适的活性炭，防止使用过程中脱粉。
2.以自来水为水源的大型纯净水设备设立独立的供水系统，这样既可以保证供水系统的稳定运行，又可以减少RO系统启停时对全厂供水管网造成的瞬间冲击。当RO装置直接从原水管网上取水时，应设置高低压保护设施，因为大多数自来水管网压力波动较大。
3.先应考虑药剂与药剂之间的兼容性，其次应考虑药剂与膜材料的兼容性。例如，RO系统中经常同时使用混凝剂，助凝剂，求购信息剂，还原剂和阻垢剂。由于天然水中的胶体一般带负电荷，所以通常使用带正电荷的阳离子型混凝剂。为了防止R0装置结垢，RO的进水端可以考虑了投加阻垢剂的措施。因此，应避免阳离子型混凝剂与阴离子型的阻垢剂发生反应，防止反应生成的胶体化合物在膜面沉积
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